关于您公司分两次发工资（一次公司账户、一次个人转账）是否算漏税的问题，需结合具体情况判断。以下为您分析不同情形下的结论：公司分两次发工资可能存在漏税风险，但并非绝对。1.若公司通过个人转账发放的工资未计入工资总额、未申报个税或未缴纳社保，属于偷税漏税行为；2.若公司已将两次发放的工资合并计入工资总额，依法申报个税并缴纳社保，则不构成漏税；3.若个人转账部分是合法的福利（如符合规定的误餐补贴）且已依法纳税，则不属于漏税。
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针对您公司分两次发工资是否漏税的问题，我们结合《中华人民共和国税收征收管理法》进行法律分析：根据《中华人民共和国税收征收管理法》（2015年修正版）第六十三条规定，纳税人隐匿收入、进行虚假纳税申报，不缴或少缴应纳税款的，构成偷税。您公司分两次发工资，若公司账户发放部分申报了个税，而个人转账部分未计入工资总额、未申报个税，属于“隐匿收入”“虚假纳税申报”，符合偷税的构成要件。税务机关可追缴税款、滞纳金，并处以50%以上5倍以下罚款；构成犯罪的，追究刑事责任。若公司已合并申报，则不适用该条款。
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针对您公司分两次发工资的情况，以下是可能影响处理的特殊情况或例外情形：1.个人转账部分为合法福利：若个人转账是符合规定的福利（如误餐补贴、差旅费津贴），且未超过免税标准，公司无需申报个税，不构成漏税。例如，公司每月通过个人转账发放500元误餐补贴（未超过当地标准），属于合法免税福利，不涉及漏税。2.员工主动要求分开发放：若员工因个人原因（如避税）主动要求公司分两次发工资，且公司已告知风险，员工需承担部分责任。例如，员工主动提出将部分工资通过个人转账发放以少缴个税，公司虽仍需承担主要责任，但员工也可能被税务机关要求补缴税款。3.公司已合并申报：若公司将两次发放的工资合并计入工资总额，依法申报个税并缴纳社保，即使分两次发放，也不构成漏税。例如，公司每月通过公司账户发8000元、个人转账发2000元，合计10000元，已按10000元申报个税，属于合法行为。
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针对您公司分两次发工资的情况，以下是可能出现的法律风险点：1.公司被税务处罚的风险：若公司未申报个人转账部分的工资，税务机关查实后，将追缴税款、滞纳金，并处罚款（税款的50%以上5倍以下）。例如，公司每月通过个人转账发放1万元工资未申报，一年累计12万元，需补缴个税约1.4万元（按综合所得计算），滞纳金按日万分之五计算，罚款最高可达7万元。2.员工承担连带责任的风险：若员工明知公司通过个人转账避税仍接受，可能被认定为共同偷税，需补缴个人所得税，甚至承担刑事责任。例如，员工明知个人转账部分未申报个税仍领取，税务机关可要求员工补缴个税及滞纳金。

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